Les confusions peuvent venir des noms français : le nom de « citronelle » peut s’appliquer à la Mélisse (Melissa officinalis) mais la véritable citronelle appartient à différentes espèces du genre Cymbopogon (Poacées tropicales).

Une confusion peut également avoir lieu avec la verveine odorante à odeur de citronelle  (Aloysia triphylla) dont les feuilles dégagent une odeur de citron au froissage, Les feuilles sont verticillées généralement par 3, à limbe lancéolé et typiquement ondulé, vert clair. Ses fleurs se regroupent en épis pyramidaux très ramifiés portant de nombreuses petites fleurs blanches dont le tube s’évase en 4 lobes avec une face interne violette. Le fruit est une petite drupe.